Исполнительное бюро ООН-Хабитат в Москве было основано в 1989 году в соответствии с Меморандумом о взаимопонимании между Центром ООН по населенным пунктам (Хабитат) и Государственным Комитетом СССР по архитектуре и градостроительству. Таким образом, история сотрудничества Российской Федерации со структурами, занимающимися в системе ООН вопросами жилищной политики и устойчивого городского развития, уходит корнями в эпоху Советского Союза, когда наша страна играла заметную роль в этой глобальной международной организации и вносила весомый вклад в формирование ее бюджета.
В соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 3 июня 2003 года № 323 «Об утверждении межведомственного распределения обязанностей по обеспечению участия России в международных организациях системы ООН» головной организацией по вопросам сотрудничества российских организаций с ООН-Хабитат до 2004 года являлся Государственный комитет Российской Федерации по строительству и жилищно-коммунальному хозяйству (Госстрой России).
Основные принципы сотрудничества, имеющего целью обеспечение устойчивого развития населенных пунктов, внесение вклада в дело реализации Повестки дня Хабитат и достижение соответствующих целей в области развития, сформулированных в Декларации о городах и других населенных пунктах в новом тысячелетии, были установлены Соглашением о Сотрудничестве, заключенном Сторонами 11 апреля 2006 года. Соглашение предусматривало совместную работу в следующих областях:
С апреля 2009 года в Москве работает Проектный офис ООН-Хабитат. В 2009 году также начала работу Комиссия по сотрудничеству между ООН-Хабитат и Межправительственным советом по сотрудничеству в строительной деятельности государств-участников СНГ. В январе 2010 года Московский офис ООН-Хабитат подписал Письмо о согласии оказывать содействие Комитету по жилью и землепользованию Европейской экономической комиссии ООН в информационной и иной деятельности.